Потпуно аутоматске центрифуге се могу категорисати у неколико типова на основу њихове примене и дизајна, укључујући:
Индустријске центрифуге: Користе се у индустријама као што су хемијска, прехрамбена и заштита животне средине, за апликације као што је одводњавање муља у третману отпадних вода и пречишћавање сокова.
Лабораторијске центрифуге: Користе се у научним истраживањима и медицинском тестирању, за апликације као што су одвајање крви и ћелијска култура.
Столне центрифуге: Мање величине, погодне за мале лабораторије или наставну употребу.
Сваки тип центрифуге има другачији фокус дизајна. Индустријске центрифуге обично дају приоритет пропусности и издржљивости, док лабораторијске центрифуге наглашавају прецизност и прилагодљивост.